Así aparece en el Libro de Protocolo del Convento, siendo prior fray Pedro de san Bernardo (1724-27), se da comienzo a la decoración de la nave principal del templo: "Se pintó todo el cuerpo de la Iglesia, el coro alto, y vaxo, se renovó la vida de Nº. Pe. Sn. Elías que estaba sobre las Capillas (como ahora lo está) y se les echó sus marcos dorados, en las pilastras se pusieron los sagrados Patriarcas, y en las lunetas del dicho cuerpo se puso la vida de Nº. Pe. Sn. Joseph, pintado en la pare, todo lo dicho a costa del cuidado y diligencia del hº Domingo de la Ascensión, ochavero desta Sta. Cassa". La decoración concluye en 1727 con el nuevo prior fray José de San Julián, incorporando los lienzos: "[...] poner todos los lienzos con sus molduras doradas como oy está. Y todo fue preparasión para selebrar las fiestas de la Canonización de Nº. Pe. Sn. Juan de la Cruz que comenzaron sábado 19 de Junio de 1728 y duraron nueve días que el último fue el 27 de dicho mes y año".
Este dato se confirma con la inscripción que se conserva en el nave del templo, en la pilastra que separa las capillas de san Juan de la Cruz y san Elías y que antes estaba oculta bajo el lienzo de san Juan de Dios: SE EMPEZÓ A PINTAR EL CUERPO DE ESTA IGLESSIA EL AÑO DE 1725, SIENDO GENERAL DE LA ORDEN Nº, Pe, fi, PABLO DE LA CONCEPZIÓN I PRIOR DE ESTA CASA fi, Pº, DE Sn, BERNARDO, I SE ACABÓ, AÑO 1727 CON LA LIMOSNA DE LOS HERMANOS DE Nª, Sª, DEL CARMEN, SIENDO PRIOR fi, JOSEPH DE Sn, JULIAN. Esta noticia, que no contiene el protocolo conventual, se refiere a los hermanos de la cofradía del Carmen existente en este templo, con cuyas limosnas se pudo decorar la nave principal.
